O Instituto Basta é divido por núcleos, sendo eles:
Núcleo de Gestão Interna – Responsável pelo Regimento Interno do Instituto.
Núcleo de Gestão Externa – Responsável pelas ações de impacto e parcerias do Instituto.
Núcleo de Finanças – Responsável pelo Financeiro.
Núcleo de Consultoria – Responsável pelo Suporte Jurídico e Psicológico as vítimas de violência e exploração sexual e suporte psicológico aos voluntários do Instituto.
Núcleo de Desenvolvimento e Capacitação – Responsável pelo Clube de Leitura e todos os tipos de treinamentos como: aulas, imersão, workshops, seminários, cursos e afins.
Núcleo de Comunicação – Responsável pela Comunicação Interna & Externa, pela projeção da imagem do Instituto, pelo planejamento e gestão de todas as mídias sociais, pela divulgação das ações do Instituto, Newsletters, Lives & Podcasts.